Introducción: Los estudios serológicos y moleculares del VIH-1 en Cuba han mostrado una seropositividad muy baja, pero una creciente diversidad genética, debido a la introducción de variantes virales de diferentes áreas geográficas y a factores epidemiológicos  que conllevaron a la elevada variabilidad observada en Cuba, con posibles implicaciones en la transmisibilidad y progresión clínica.

Objetivo: Estudiar la variabilidad genética del VIH-1 en Cuba y sus implicaciones en la transmisibilidad y la progresión.

Materiales y Métodos: Se caracterizaron los genes estructurales mediante dos métodos de caracterización molecular en 590 seropositivos cubanos  seleccionados según la prevalencia por provincias, Los resultados moleculares se asociaron con factores relacionados con el virus, las características del hospedero y variables clínico-epidemiológicas-conductuales.

Resultados: El análisis molecular permitió clasificar  297 muestras como subtipo B, 269 como No B y 24 resultaron no tipables. El subtipo B resultó mayoritario, con un alto grado de conservación y predominó en la población de HSH mientras que los No B, predominantes en mujeres y hombres heterosexuales mostraron múltiples variantes y formas recombinantes. La vía sexual fue la forma de contagio que prevaleció. Los subtipos B y No B, se encuentran distribuidos en todas las provincias del país. No se encontró asociación entre los subtipos con la transmisibilidad y progresión clínica, aunque la proporción de enfermos y fallecidos resultó superior en el subtipo B, no hubo diferencias en el tiempo medio en que enferman y fallecen los pacientes.

Conclusiones: Estos resultados sugieren que los subtipos B y No B del VIH-1 encontrados en Cuba no difieren en la transmisibilidad y en el rango de progresión clínica de la enfermedad.